Ситуация такая - соседи сверху затопили нашу ванную комнату.
В результате провис навесной потолок. Мы сделали дырочку и вода вроде как оттуда вышла. Вода была черная (из стиралки).

Если я правильно понимаю, то если сейчас не заменить потолок и не прочистить штукатурку верхнего перекрытия, там образуется грибок и в итоге скоро будет вонять (ванная же - влажно, ну и вода была из стиралки)

Вопрос:
Сколько может стоить восстановление потолка? И что вообще должно включаться в смету?

А зачем вы дырочку в потолке делали? Обычно сливают через лампочку или потолок снимают.
Сколько вода стояла?
По идее все довольно просто, если вода стояла мало:
1. Снять полоток.
2. Просушить все.
3. Натянуть потолок.
Ничего чистить не надо.

Дырочку по совету строителей сделали
Вода стояла сутки где-то, может больше (нас не было)

Почему чистить не надо? Там ведь грязная вода была из стиралки. В ней же полно всякой нечисти, а среда в ванной комнате как раз располагает к её распространению.

Вытяжка где у вас? в потолке?
По мне так просушить будет достаточно. Или обработайте средством от грибка хорошим, что-нибудь типа цересита, стоит в пределах 500 руб.
По цене потолка позвоните потолочникам, вам скажут цену потолка. При замене они используют тепловые пушки, попросите, чтобы еще хорошо сам потолок погрели - так сказать посушили напоследок.
Если было освещение, то заложите как минимум его проверку. Ничего не замкнуло? Автоматы есть, проводка не погорела?

Площадь ванной-то какая? Я думаю в пару тысяч удаление штукатурки вы уложитесь. Но я бы не стал ибо грязь только разводить.