нужно закрыть ИП,подскажите пожалуйста как это делается на сегодняшний день.

1. оплатить госпошлину 160 руб.
2. оформить заявление по форме Р26001
3. вместе с паспортом, квитанцией об оплате госпошлины и заявлением явиться в налоговую инспекцию лично. либо отправить квитанцию и заявление заказным письмом с описью вложения. если отправляете почтой, то заявление должно быть заверено нотариусом (это еще дополнительно 250 руб.).

при подаче документов в очном порядке, специалист в налоговой может вручить вам т.н. "бегунок" и до приема у вас документов заставить вас бегать по кабинетам - ставить печати и подписи, доказывающие, что вы не жираф. помните, что на подобное поведение у налогового работника нет никаких оснований, т.к. порядок прекращения деятельности в качестве ИП носит уведомительный, а не разрешительный характер.

а что делать с ПФР?

В теории (т.е. по закону) получить справку о задолженности от ПФР. На практике погасить задолженность и получить справку об отсутствии задолженности.

В теории (т.е. по закону) такого уже нет:

Из комментариев к Федеральному закону от 08.12.2010 N 339-ФЗ "О внесении изменений в Федеральный закон "О страховых взносах в Пенсионный фонд Российской Федерации, Фонд социального страхования Российской Федерации, Федеральный фонд обязательного медицинского страхования и территориальные фонды обязательного медицинского страхования" и отдельные законодательные акты Российской Федерации":

"В соответствии с действующей редакцией ч. 6 ст. 16 Федерального закона от 24.07.2009 N 212-ФЗ в случае прекращения деятельности до конца расчетного периода предприниматель обязан подать отчетность по взносам до дня подачи заявления о госрегистрации прекращения своей деятельности. С 1 января 2011 г. это правило изменится: расчет по взносам необходимо будет представлять в 12-дневный срок с даты госрегистрации прекращения деятельности. Аналогичные правила ранее были установлены для адвокатов и нотариусов (ч. 7 ст. 16 Федерального закона от 24.07.2009 N 212-ФЗ)."

что касается практики, то действительно налоговые работники могут отправить вас за справкой в ПФ, однако такой обязанности у вас нет. равно как и нет обязанности бегать с обходным листом по кабинетам налоговой.

из личного примера: в конце декабря 2011 г. закрывали ИП жене в ФНС N8. тетка в окошке всучила бегунок и потребовала нести справку из ПФ. после жесткого напоминания о том, что делать это мы не обязаны, ворча и бурча все-таки приняла заявление. через неделю свидетельство о прекращении деятельности ИП было на руках без всяких проблем.
поэтому смело доказывайте свою правоту в споре со спиногрызами из ФНС и ПФ.

четко.. а вот был период, когда я не вел деятельность по ИП (целый год), а работал на дядю, при этом ИП не закрывал, сейчас снова ИП работает, но не хочу платить в ПФР за тот потерянный год, возможно ли это сделать???
... ато бумашки всякие приходят с требованием оплатит за тот самый период, когда по ИП деятельность не вел..

в этом случае уже ничего не поделаешь - рано или поздно придется платить. конечно, если этот самый "потерянный год" приходился на период до 2010 года, и в этот период вы находились в отпуске по уходу за ребенком до достижения им полутора лет, то основание не платить у вас есть.
в любых других случаях единственное основание, при котором можно не платить фиксированный взнос в ПФ - это не быть зарегистрированным в качестве ИП.

сейчас ПФ в конец оборзел - после введения в действие Закона 212-ФЗ, они даже мам-ИП не освобождают от уплаты фиксированного взноса, нарушая тем самым их конституционные права. сейчас с женой как раз боремся с беспределом этих спиногрызов. и при необходимости доведем дело до суда.

а может подскажите юриста в этом деле?!
ну вот из за принципа не хочу отдавать им свои кровные, за тот период, когда не работал по ИП, а в итоге выходит и работададель отстегивал за меня в этот жидо фонд

ну я ж говорю, что в вашем случае отдавать все равно придется. и никакой юрист здесь не поможет, т.к. осуществление деятельности ИП с одновременным работой по найму не является основанием для освобождения от уплаты страховых взносов.